种子法第21条和四川省种子管理条例第9条规定，申办种子生产许可证要经过如下程序：
（1）商品种子生产单位或个人在播种前一个月向有关农业行政主管部门（种子管理部门）提出申请，递交下列资料：单位负责人签署的《种子生产许可证申请表》；农作物种子生产基地情况介绍；主要技术人员资格证明；注册资本证明；检验设施和仪器设备清单及产权或使用权证明；种子生产质量保证制度等。
（2）种子管理部门核实，必要时种子管理部门可以到基地检查，对条件符合要求的由农业行政主管部门发给《种子生产许可证》。种子生产单位根据许可内容进行生产。
（3）种子管理部门发现生产单位未按要求进行生产，可根据具体情况，取消生产单位的生产资格，收回《种子生产许可证》。
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